11月16日（下週一）起將開放各級學校施打H1N1疫苗，其中，高雄縣國小學童率先開打，隔週為國中生，最後則是專科前三年級學生，將委由醫療院所到校集中接種，而包括三原民鄉、甲仙及田寮鄉，因學生人數稀少，則由衛生所派人施打。
高雄縣災民、醫護人員及六個月以上一歲以下嬰兒已陸續施打H1N1疫苗，下一階段施打順序為孕婦、ㄧ歲以上至國小入學前幼兒、重大傷病者及國小學童，將於11/16同時施打，隔週11/23為國中生，11/30高中生及專科1-3年級學生。
衛生局表示，國小、國中、高中生及專科1-3年級學生，高雄縣共有18萬人，由衛生局委託醫療院所統一到校集中施打，其中，國小1?3年級施打兩劑，而那瑪夏鄉、桃源鄉、茂林鄉、甲仙鄉及田寮鄉因人數較少，將由各衛生所派人施打。
此外，有關H1N1各級學校停課狀況，統計至11月9日為止，全縣共有62校138班停課，9校11班、共計342人目前仍停課中，包括鳳山區30所80班，尚有3所3班停課；岡山區計有20所41班停課，6所8班仍停課中；旗山區則有6所8班曾停課，皆已復課。